Dopo la vittoria nel Gran Premio di Aragon, "Pecco" Bagnaia e la sua Ducati non vogliono farsi scappare l'occasione di stupire anche a Misano. Le Ducati piazzano Francesco Bagnaia primo (1'31''936 ) e l'australiano Jack Miller (+0.153) terzo nelle libere 3 del Gran premio di San Marino di MotoGp, con il leader del mondiale, Fabio Quartararo (+0.039), su Yamaha ufficiale, a completare, con il secondo tempo, le prime tre posizioni. Quarto Joan Mir (Suzuki) e poi Maverick Vinales su Aprilia, Alex Rins su Suzuki, Johann Zarco (Pramac racing), Pol Espargaro (Repsol Honda), quindi Jorge Martin e Michele Pirro (entrambi Pramac Racing) a chiudere la top ten. Valentino Rossi, che ha corso con un casco dedicato alla futura figlia (un fiocco rosa e, sul retro, quattro versi tratti dalla canzone 'Con il nastro rosa' di Lucio Battisti) è 19/o, dopo essere stato protagonista di una caduta con scivolata senza particolari conseguenze.